长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。具有mRNA样结构，有些具有poly(A)尾巴，有些没有poly(A)尾巴，分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式，与mRNA相比，lncRNA表达量更低。在细胞核、细胞质和细胞器均有分布.大部分分布于细胞核中。

1.原始数据处理

2.Mapping至参考基因组

3.mRNA表达量统计和表达差异分析

4.反义转录本鉴定

5.差异基因富集分析

6.可变剪切

7.新转录组本预测

8.已知lncRNA鉴定

9.新lncRNA预测

10.lncRNA位置分布

11.lncRNA表达量统计和表达差异分析

12.lncRNA靶基因预测

13.靶基因GO,KEGG富集分析

14.lncRNA保守性分析

15.lncRNA-mRNA共表达分析

16.LncRNA-mRNA-miRNA共表达分析

组织样品：

动物组织：>2g

植物组织：>4g

培养细胞：>1×10⁷个

血液样品：≥2ml

RNA样本：

浓度≥200ng/μl

总量≥10μg

OD260/280在1.8-2.2之间，RIN≥7